内部审计是通过内部进行一项独立客观和咨询的营运活动的了解及报告。目的是为了提升组织的价值和改善组织的营运；通过评价和改善组织的风险管理、内部控制和管理过程的有效性，帮助组织改善营运效果。
新山中华公会于2005 年由财务组建议成立‘内部审计制度’，当时的财政为黄循积即现任第一副会长。目的是让公会的财务管理更透明化，同时将财务管理提升至企业化管理的水平。当时审计的方式是以问卷发给各个有关部门，由该部门将该月的运作或活动中的收入与开销填写在问卷内，并呈交给财务部作为评估根据。
2007年4月26 日，理事会通过成立以梁德海为首的内部审计筹备委员会。该委员会于5月15日召开第一次会议，并初步拟定委员会的结构、权限及责任规章。其后，在委员会完成其拟定规章及筹组工作后，同年7月26日理事会议议决解散内部审计筹备委员会，并正式成立内部审计委员会，重新委任梁德海为内部审计委员会主席。
委员会建议把内部审计工作外包给会计公司，并获得理事会的接纳。2008年本会接受由Ernst & Young 公司负责规划内部审计工作，於是年1月1日开始与各部门主管进行交流，以探讨了解实际的运作状况。该公司提供每部门五个运作流程之规划，并于8月份完成本会第一次的内部审计工作。至今内部审计的工作仍然以外包的形式进行，每年进行2-3 次的审计工作。经过5年的内部审计工作，每每审计师完成一次审计工作，都会在报告书内针对有关部门的运作提出改善建议，而许多建议也被本会接纳。因此，各部门在运作上所面对的风险管理及控制方式都有很好的改善。
为迎合公司法令以及良好的企业管治方式，故本会设立了内部控制系统委员会。其目的是将每个部门的运作进行分解，以实践经验为依据，安全、质量效益为目标，对作业过程进行改善，确保经营活动的效率性和效果性，资产的安全性、经营讯息和财务报告的可靠性，从而形成一种优化作业程序，逐步达到准确、高效、省力的作业效果。
2007年7月26日， 理事会议决成立内部控制系统委员会，主席为张载洲，委员除了指定的理监事外，也包括各管委会及小组主任与主管。同年，张载洲的公司合作伙伴也义务为公会完成了义山以及中华山庄的内部控制系统程序。
本届委员会主席甘再福为了落实对各部门进行标准作业程序（SOP）的了解，已在2011年11月份完成初步的标准作业程序（SOP）工作，并进行审阅后的交流会，同时加以修定，使之更符合内部审计委员会的要求标准。经过十九次与各部门的交流会议后，所有的标准作业程序已提呈理事会议并获得通过，而各部门亦逐步落实之。